工程师詹宁斯(本·阿弗莱克 Ben Affleck饰)是个高科技天才。他屡屡受聘于各种项目研究,获得丰厚酬劳,但为了高度保密,条件是完工后他必须被删掉大脑中的短期记忆。此次詹宁斯的任务报酬达到了天价,而他必须花费长达几年的时间投身于这个新产品研发。 当产品完工后,令人意外的事情发生了。詹宁斯竟然没有得到承诺的报酬,取而代之的是一个信封,里面装着一封他自愿放弃酬劳的声明。 詹宁斯大为惊讶,当他要查个水落石出时,却发觉麻烦惹得越来越大了。联邦调查局和公司的老板都对他穷追不舍,要把他置于死地。这一系列神秘的事件,更让詹宁斯相信,背后肯定有着不为人知的真相。果然,一场周密的阴谋随着他的追查渐渐浮出水面。
杰森·伯恩事件引起连锁反应,踏脚石(Treadstone)计划以及CIA用药物控制强化特工的行径通过报纸公之于众,令其幕后人物坐立不安。为了阻止满盘皆输的局面出现,CIA高层决定中止该计划,并将相关特工人员以及科学家从行动中抹杀。在此后的日子里,那些深藏在国家政治最底层、依靠蓝绿药丸执行各种绝密任务的特工相继殒命,而负责染脏双手的执行人——前美国空军上校艾瑞克·贝尔(爱德华·诺顿 Edward Norton 饰),正慢慢将屠刀伸向隐藏在位于阿拉斯加崇山峻岭、暴雪深山中的特工艾伦·克劳斯(杰瑞米·雷纳 Jeremy Renner 饰)。 突如其来的炮火袭击令艾伦意识到自己所处的危险境地,在之后的日子里,他不仅要在昔日同伴的追杀中求生,还必须设法找到那曾为他提供源源不断体能和智力的蓝绿药丸……